Geuzen & Papen is de zesde aflevering van Het verhaal van Nederland, waarin protestanten nog steeds door de katholieke overheid worden vervolgd, maar toch hun aanhang zien groeien. Als vertrouweling van de Spaanse koning en zijn halfzus Margaretha van Parma weigert prins Willem van Oranje na de beeldenstorm de kant van de protestantse geuzen te kiezen. Wanneer de hertog van Alva naar de Nederlanden wordt gestuurd om de schuldigen te straffen, vlucht Willem naar het Duitse Dillenburg. Daar gaat een team schrijvers en tekenaars aan het werk om zijn imago van lafaard en verrader om te turnen tot "redder van het vaderland". Zijn pogingen om de Nederlanden te bevrijden hebben echter weinig succes. Pas wanneer een ongeregelde troep Watergeuzen voor de poorten van Den Briel belandt, komt de Nederlandse Opstand echt op gang.